南科大医学院的定位是建设一所扎根深圳、面向中国和世界、理工医人文交叉融合、水平一流、国际化的研究型医学院；以培养具有国际视野、开拓精神和创新能力、德才兼备的医学领军人才，探索医学未知、引领一流科研、推进医学发展，和追逐精湛医技/医疗、提供优质临床服务为最高使命。

截至2021年11月，医学院总人数254（含访问类），其中教职工178人。院士1人，教研系列讲席教授5人、教授9人、副教授8人、助理教授12人；教学系列教授3人，副教授1人；研究系列研究副教授2人，研究助理教授17人。